میکروسکوپ آزمایشگاهی از وسیله های بسیار مهم تجهیزات آزمایشگاهی می‌باشد که برای مشاهده نمونه ها با بزرگنمایی بالا مورد استفاده قرار می‌گیرد. تمامی میکروسکوپ ها بر اساس نور و طول موج های متفاوتی کار می‌نمایند، نحوه ی تشخیص کیفیت این میکروسکوپ طبق تنظیم نور می‌باشد. معمولا عدسی به کار رفته در میکروسکوپ همگرا است، این دستگاه شامل پایه و لوله و عدسی های شی ای است. میکروسکوپ ها در آزمایشگاه های مدرن کاربردهای بسیاری دارند برای مثال در بخش های آسیب شناسی که معمولاً توسط پزشکان برای مشاهده نمونه های بیمار به عنوان مثال مورد استفاده قرار می گیرد.
میکروسکوپ ها به دانشمندان کمک می نماید تا میکروارگانیسم ها، سلول ها، ساختارهای بلوری و ساختارهای مولکولی را مورد مطالعه قرار دهند. علاوه بر این، وقتی پزشکان با استفاده از آن ها نمونه های بافت را معاینه می کنند و به همین دلیل یکی از مهمترین ابزارهای تشخیصی محسوب می شوند.
میکروسکوپ ها در مشاهده نمونه هایی که از نظر اندازه کوچک هستند استفاده می‌شودکه از آنها برای مشاهده ساختارهای سلولی اندام ها، میکروب ها و باکتری ها استفاده می‌شود. استفاده از میکروسکوپ برای آزمایش بافت ها و ارگانیسم هایی که بسیار کوچک هستند و با چشم غیر مسلح دیده نمی شوند بسیار مهم است.
همه شاخه های زیست شناسی از میکروسکوپ ها به ویژه در زیست شناسی مولکولی و بافت شناسی (مطالعه سلول ها) استفاده می‌کنند، میکروسکوپ ستون فقرات مطالعه زیست شناسی است ، زیست شناسان از آن برای مشاهده جزئیاتی که با چشم غیر مسلح مانند انگل های کوچک و کوچک مشاهده نمی‌شود استفاده می‌کنند. ارگانیسم هایی که برای تحقیقات کنترل بیماری مهم هستند.